2024-06-28 업데이트 노트

2024년 6월 28일 하이퍼랩 업데이트 노트입니다.

하이퍼랩 버전 : 2024.06.28

하이퍼랩 변경 사항

1. 하이퍼 디자인 Fragment 선택 범위 개선

하이퍼 디자인에서 Replace를 수행할 때, Multiple fused ring에 대해서는 1개로 선택할 수 있었던 Fragment를 선택 범위를 Multiple fused ring 내 각각 개별 Ring에 대해서도 수행이 가능하도록 개선하였습니다.

2. Bench 별 활성 단백질 구조 변경이 가능하도록 변경

(1) Protein structure 페이지 내 활성 단백질 구조 변경 사항

Protein structure 페이지에서 My bench와 Project bench에 각각 다른 단백질 구조를 활성화할 수 있도록 변경하였습니다. 단백질 구조 리스트 테이블의 Project bench와 My bench 열에 있는 Active, Inactive 버튼을 통해 각각의 Bench의 활성 단백질 구조를 자유롭게 변경할 수 있습니다.

My bench의 활성 단백질 구조는 자유롭게 변경할 수 있지만, Project bench의 활성 단백질 구조는 해당 프로젝트의 ‘프로젝트 매니저’ 이상의 역할부터 변경할 수 있습니다.

(2) Bench에서 활성 단백질 구조를 바로 변경할 수 있도록 개선

활성 단백질 정보가 표시되던 각각 Bench의 우측 상단 화면에서 클릭을 통해 손쉽게 현재 Bench의 활성 단백질 구조를 변경할 수 있도록 개선하였습니다. Protein structure 페이지로 직접 이동해서 활성 단백질 구조를 변경할 필요 없이 Bench에서 클릭을 통해 활성 단백질 구조를 변경할 수 있습니다.

활성 단백질 구조를 비활성화하거나, 신규 단백질 구조 추가, 활성 단백질이 없는 Bench의 단백질 구조 활성화 변경은 기존과 동일하게 Protein structure 페이지에서 수행할 수 있습니다.

3. 2D 구조 분자 배향 일치 개선

하이퍼 디자인으로 생성한 분자들에 대해서 디자인 전/후 변하지 않는 구조들의 배향이 동일한 배향을 가지도록 개선하였습니다.

4. 2D 분자 구조 원자 색상 ‘검정(Black)’으로 변경

기존 2D 분자 구조에서 고유의 원자 색상으로 표현이 되는 방식에서 모두 공통으로 검정(Black)으로 적용되는 형태로 변경하였습니다. 3D Viewer 내에 표시되는 2D 분자 구조는 기존과 동일하게 고유의 원자 색상으로 표시됩니다.

5. 사용자 필드 데이터 타입 변경 가능 유형 추가

My bench와 Project bench에서 기존 사용자 필드에서 제공되지 않던, [텍스트 타입 필드] → [태그 타입 필드] 변경 유형이 가능하도록 개선되었습니다. 텍스트 타입에서 태그 타입으로 필드의 데이터 타입이 변경될 경우, 기존 텍스트 내의 ' , '을 기준으로 개별 태그 형태로 변경됩니다.

6. 단백질 구조 추가 방식 변경

단백질 구조를 추가하는 방식 및 역할별 권한이 변경되었습니다.

(1) 신규 단백질 구조 추가 시 Receptor, Binding site 탭 선택 항목 추가

신규 단백질 구조를 추가할 때 Receptor와 Binding site를 선택할 수 있는 다음의 항목을 추가하였습니다. 각각의 항목들은 추가하려는 단백질 구조에 따라서 노출되는 정보가 다를 수 있습니다.

[Receptor 탭]

RNA : 불러온 3D 구조에 포함된 RNA 염기서열입니다. 3D 구조에 RNA 염기서열이 포함되지 않으면 아무 정도도 표현되지 않습니다.

[Binding site 탭]

Protein residues : 단백질 서열의 아미노산들입니다. <chain>-<residue name>-<residue number>로 표현됩니다.
DNA residues : DNA 서열의 염기들입니다. <chain>-<residue name>-<residue number>로 표현됩니다.
RNA residues : RNA 서열의 염기들입니다. <chain>-<residue name>-<residue number>로 표현됩니다.