Ligand Display
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3D 뷰어의 Ligand Display 영역 사용 방법 입니다.
Molecule을 다루기 위한 여러가지 기능이 제공됩니다.
이러한 기능들은 구조에 대한 인사이트 제공에 도움이 됩니다.
Ligand Display는 최대 7개의 정보를 보여줍니다. 단백질의 Type이 3D Structure일 경우 모든 분자에 대해 공통의 단백질 구조가 보여지며, Sequence일 경우 각 행마다 조금씩 다른 구조가 보여질 수 있습니다. 따라서 Sequence 단백질에 대해서는 Protein 색상 설정 기능이 추가로 제공됩니다.
Mol ID: 분자 이름
Conf. ID: Hyper Binding에서 생성된 Conformer ID
BS (kcal/mol): Binding Score
Magnifying Glass: 확대 기능
눈 모양 아이콘: 리간드와 단백질의 활성화/비활성화 기능. 두번 클릭시 핀으로 고정 가능.
Ligand: 분자의 색상 설정. 원자에 적용
Protein: 단백질 색상 설정.
Mol ID 옆에 있는 화살표는 콘포머 목록을 숨기고 있다는 의미입니다 (예: 10개 중 9개 숨김).
해당 화살표를 클릭하면, 모든 Confomer와 그에 따른 결합 점수를 확인할 수 있습니다.
각 Confomer를 확인하려면, 눈 모양 아이콘을 클릭하세요.
Ligand와 Residue 간의 상호작용을 3D로 자세히 보려면, 돋보기 아이콘을 클릭하세요.
특정 Confomer 또는 분자를 고정(Pin) 하려면, 눈 모양 아이콘을 클릭하여 자물쇠 아이콘이 나타날 때까지 누르세요.
자물쇠 아이콘이 표시된 상태에서는, 다른 Confomer의 눈 모양 아이콘을 클릭하여 두 구조 간의 차이를 비교할 수 있습니다.
모든 Confomer를 한눈에 보고 싶을 경우, 열 상단에 있는 눈 모양 아이콘을 클릭하세요.
배경을 검은색으로 변경하고 싶을 경우, 다크 모드를 사용할 수 있습니다.
다크 모드를 설정하려면, 오른쪽 상단에 있는 슬라이더를 클릭하세요.
