하이퍼 ADME/T 계산
Hyper ADME/T는 등록된 분자의 PK/PD 특성 및 독성을 AI로 예측하는 기능입니다.
의약화학에서는 특정 화합물의 물리화학적 특성을 기반으로 흡수/투여(A), 분포(D), 대사(M), 배출(E), 독성(T) 등의 ADME/T 적합성을 고려해야 합니다. Hyper ADME/T는 이러한 핵심 특성 지표들을 AI 기술을 이용해 예측할 수 있으며, 총 세 가지 방법으로 계산을 수행할 수 있습니다.
방법 1. Bench에서 계산하기
Bench의 하이퍼 ADME/T 필드에서 실행 버튼을 클릭하여 하이퍼 ADME/T를 계산을 실행할 수 있습니다.
방법 2. Molecule 상세 페이지에서 계산하기
Bench에서 원하는 분자의 상세 페이지로 진입합니다.
스크롤을 내려 Properties의 우측 [ADME/T 계산 실행] 버튼을 클릭합니다.
방법 3. Molecule 업로드 창에서 계산하기
화합물을 Bench에 새로 등록하면서 Hyper ADME/T 계산을 동시에 설정할 수 있습니다. 분자 업로드 창에서 ADME/T 계산 옵션을 활성화하면, 등록된 분자에 대해 자동으로 ADME/T 예측이 수행됩니다.
예측 결과 항목 설명
(1) Physicochemical properties
LogD at pH7.4: 생체 pH 7.4에서 이온형과 비이온형 전체를 포함한 Octanol-water 분배 계수의 로그값 예측 결과입니다 (무차원, pH 의존).Solubility: 중성 pH에서의 용해도를 logS 단위(log [mol/L])로 예측합니다.Insoluble: logS<−6logS < -6logS<−6
Moderate: −6≤logS≤−4-6 \le logS \le -4−6≤logS≤−4
Soluble: −4≤logS-4 \le log S−4≤logS
(2) Medicinal chemistry
Druglikeness: 여기서 말하는 약물 유사성은 알려진 약물들의 밀도 추정 기반으로 예측됩니다. 참고: [Chem. Sci. 13: 554 (2022)]. 수치가 100에 가까울수록 해당 화합물이 약물일 가능성이 높습니다. 주요 데이터베이스의 평균 값은 다음과 같습니다:FDA 승인 약물: 74.5
ChEMBL 분자: 60.5
GDB-17 분자: 40.5
Synthesis complexity: 상용화된 빌딩 블록과 널리 알려진 화학 반응을 이용해 분자를 합성하는 데 필요한 단계 수를 예측한 값입니다. 참고: [J. Chem. Inf. Model. 2024, 64, 7, 2432–2444]CNS MPO: CNS 약물 설계를 위한 멀티 파라미터 점수(0–6)로, 점수가 높을수록 CNS 적합성이 높음을 의미합니다. 하이퍼랩에서는 2017년에 보고된 CNS MPO 스코어링 시스템을 기준으로 LogP, TPSA, Molecular weight, Most basic pKa, 그리고 수소 결합 공여자 수(2배 가중) 등 다섯 가지 물성을 기반으로 점수를 산출합니다.
(3) ADME/T
Metabolic stability: Human/Mouse liver microsome assay에서 초기 농도 2 μM의 화합물이 30분 내에 50 % 이상 분해 될 것으로 예측될 시 “Unstable”로 표시됩니다.PAMPA: ‘High’는 이 화합물이 7×10−6cm/s7 \times 10^{-6} cm/s7×10−6cm/s 이상의 투과성을 가질 것으로 예측된다는 의미입니다.P-gp inhibitor: 'Yes'는 이 화합물의 Reversal Fold (RF) 비율이 5 이상일 가능성이 있음을 의미하고, 'No'는 RF 비율이 4 미만일 가능성이 있음을 의미합니다.P-glycoprotein (P-gp)은 종양 세포에서 다약제 내성(MDR) 현상을 유도할 수 있으며, RF 비율은 다약제 내성 역전(MDRR) 실험에서 사용됩니다.
RF = (Reversal Fold 값)
BBB penetration: 화합물의 log([뇌내 농도] / [혈중 농도])가 -1보다 클 것으로 예측될 시 "High"로 표시됩니다.CYP inhibitor: 화합물의 IC₅₀가 10 μM 이하로 예측될 시 “Yes”로 표시됩니다.CYP1A2 inhibitorCYP2C19 inhibitorCYP2C9 inhibitorCYP2D6 inhibitorCYP3A4 inhibitor
CYP substrate: 화합물이 CYP의 기질로 예측될 시 “Yes”로 표시됩니다.CYP1A2 substrateCYP2C19 substrateCYP2C9 substrateCYP2D6 substrateCYP3A4 substrate
hERG inhibitor: 화합물의 IC₅₀가 10 μM 이하로 예측될 시 “Yes”로 표시됩니다.
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