하이퍼 바인딩 결과 파일로 저장하기

하이퍼 바인딩/디자인/스크리닝 계산이 완료된 분자들은 SDF 형식 파일로 결과를저장할 수 있습니다.

SDF 형식 파일은 분자의 3차원 구조 정보가 포함되어 있어 표적 단백질과의 결합 형태를 보는데 용이합니다.

AI 실험 결과를 파일로 저장하는 방법은 다음과 같습니다:

위 그림의 1번이나 2번처럼 전체 또는 저장하고자 분자들의 가장 왼쪽 체크박스를 체크하여 선택합니다.

한번에 여러 분자를 선택하고 3번을 눌러 다운로드하면 한 파일에 여러 분자의 AI 예측값이 저장됩니다.

[ 전체 선택 ]의 경우 분자 선택 상태에 따라 동작이 달라 집니다.

• 아무것도 선택 안된 상태 or 일부 선택 상태; 전체선택

• 전체 선택 상태: 모든 선택 해제

파일 이름은 임의로 생성되니 다운로드 후 수정하시기 바랍니다.

저장된 SDF 파일엔 분자의 3차원 구조 정보와 함께 다음과 같은 정보도 함께 저장됩니다.

1. 분자 이름 (5번 항목과 동일)

2. "minimizedAffinity": 도킹 기법에서 계산되는 결과값

3. "conformer_id": 도킹에서 지정한 분자 결합 형상 ID

4. "StereiochemDone": 분자 입체배치(Stereochemistry) 적용 여부 (1: 적용, 2: 미적용)

5. "Name": 분자 이름 (1번 항목과 동일)

6. "SMILES": 분자 SMILES 정보

7. "BindingScore": AI로 예측한 단백질-분자 결합 에너지값

하이퍼 바인딩은 분자 도킹을 통해 표적 단백질에 대한 다양한 결합 구조를 생성하고, 각각에 대한 결합 에너지를 예측합니다. 따라서 결과 파일에서 각 분자에 대한 1개 이상의 결합 구조와 에너지 값을 확인할 수 있습니다.

SDF 파일은 ChemDraw, DataWarrior와 같은 화학 데이터 시각화 프로그램에서도 열람할 수 있습니다.

현재 하이퍼랩은 SDF 외 다른 형식의 파일로 저장하는 기능을 지원하지 않습니다.