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  • 방법1. 단백질 검색하여 추가하기를 이용해 체인을 추가합니다
  • 방법2. 직접 체인을 추가합니다
  1. 프로젝트 기능
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  3. 단백질 추가 및 활성화

Sequence 단백질 추가

2가지 방법을 통해 Sequence 단백질을 추가할 수 있습니다.

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Last updated 2 months ago

방법1. 단백질 검색하여 추가하기를 이용해 체인을 추가합니다

추가를 원하는 단백질의 Gene name, Protein name으로 검색해 추가할 수 있습니다.

1

단백질 등록을 위해 단백질 추가 버튼을 클릭해 주세요.

2

등록 유형을 Sequence 로 설정해 주세요.

3

단백질 검색하여 추가하기 버튼을 클릭해 주세요.

4

추가할 단백질의 정보를 입력해 주세요. Protein name, Gene name, Organism, UniProt ID, PDB ID 정보를 이용할 수 있습니다.

5

검색 결과에서 추가를 원하는 단백질을 선택후 다음버튼을 클릭합니다.

6

선택한 단백질에 Mutation, PTM, Coenzyme 등 여러개의 세부 옵션이 있을 경우 옵션과 예시 3D 구조가 보여집니다. Ligand가 active compound일 가능성이 높을수록 상위에 정렬됩니다.

원하는 옵션값을 가진 단백질을 선택후 다음 버튼을 클릭합니다.

7

마지막으로 선택한 단백질의 세부 정보를 확인 후 추가 버튼을 클릭합니다.

8

추가된 단백질 체인 정보를 확인할 수 있습니다.

단백질 이름 확인 후 저장 버튼을 클릭하면 단백질 등록이 완료됩니다.

9

계산이 완료된 후 단백질을 활성화해 AI 실험을 수행할 수 있습니다.

방법2. 직접 체인을 추가합니다

단백질의 Sequence 정보를 알고 있다면 직접 체인을 추가해 단백질을 등록할 수 있습니다.

1

Type을 선택해 줍니다.

Type은 Protein, RNA, DNA, Coenzyme, Ionorganic ion을 지원합니다. 추가를 원하는 체인의 타입을 설정합니다.

2

Copies 정보를 설정합니다.

같은 체인 정보를 여러번 추가할 경우 Copies 수를 설정해 하나의 체인으로 여러개의 단백질 체인을 추가할 수 있습니다.

3

체인 정보를 입력합니다.

Protein RNA, DNA의 시퀀스 정보를 입력해 줍니다. Coenzyme은 smiles를 입력, Inorganic ion은 이온 정보를 선택해 줍니다.

4

(선택) PTM & Modification을 설정합니다.

필요에 따라 PTM 설정이 가능합니다. Protein Type 체인 우측 ... 버튼을 클릭, PTM & Modification 설정을 클릭해 줍니다.

5

설정을 원하는 아미노산을 선택 후 제공 PTM 영역의 옵션값을 선택합니다.

선택 결과에 추가된 것을 확인 후 확인 버튼을 클릭합니다.

6

(선택) Binding site를 설정합니다.

필요에 따라 Binding site 설정이 가능합니다. Protein, RNA, DNA Type 체인 우측 ... 버튼을 클릭, Binding site를 클릭해 줍니다.

7

Binding site 설정을 원하는 아미노산을 선택합니다.

선택 결과에 추가된 것을 확인 후 확인 버튼을 클릭합니다.

8

단백질 이름 설정 후 저장 버튼을 클릭하면 단백질 등록이 완료됩니다.

9

계산이 완료된 후 단백질을 활성화해 AI 실험을 수행할 수 있습니다.